Фильм представляет из себя альтернативную концовку популярного аниме-сериала «Евангелион». Дело в том, что многие зрители остались недовольны двумя последними сериями сериала, так как те в основном описывали внутренние переживания героев, и практически ничего не объясняли в сюжете. Студию завалили письмами с жалобами. После этого Хидэаки Анно принял решение сделать альтернативную концовку, ставящюю точку в сюжете. Однако многие поклонники данного аниме говорят о том что это не альтернативная концовка, а единственный конец, 25 и 26 серии сериала происходят до «Конца Евангелиона». Эти серии были показаны, якобы, из-за цензуры вместо того продолжения, которое мы видим в «Конце Евангелиона». Это объясняется большим количеством кровавых сцен. Фильм состоит из двух частей, заменяющих 25 и 26 серии оригинального сериала. В сериале в этих сериях не было показано действия, только внутренняя борьба героев с самими собой.